梵蒂冈档案馆馆长在圣诞节夜里遇害，凶手割去了他背上的一块皮肤并留下一个符号。意大利国家安全局长请来正在罗马旅行的符号学家白兰心，而馆长收养的孙女也来到现场，她找到拿到了馆长留下的钥匙，并邀请白兰心与她一起寻找馆长守护的宝藏。此后接连发生四起命案，死者背上都被割去一块皮肤。与此同时，美国国防部副部长收到勒索信，受到胁迫不得不出卖国家安全。白兰心和索菲娅经历诸多磨难，终于解开馆长的真实身份，而他所守护的秘密就是传说中的魔法石。通过一系列复杂推理，白兰心发现列奥纳多·达·芬奇可能知道魔法石的下落并巧妙地将它隐藏在画中。在新年到来之时，一切凶案的幕后主使终于现身，而此时的梵蒂冈正面临被卫星摧毁的危机。